Показатель дефицита бюджета в форме 0503117 может отличаться от расчетной величины
Значение в графе 4 по строке 450 «Результат исполнения бюджета (дефицит/профицит)» Отчета об исполнении бюджета (ф. 0503117) может не совпадать со значением, которое рассчитано как разность показателей строки 010 «Доходы бюджета — всего» и строки 200 «Расходы бюджета — всего» по графе 4.
Объяснить отклонения нужно в Сведениях об изменениях бюджетной росписи главного распорядителя бюджетных средств (ф. 0503163). Как указало в одном из писем ведомство, если такие изменения раскрыты полностью, отклонения считаются обоснованными.
Письмо Минфина России от 02.08.2016 N 02-06-10/45227; Письмо Минфина России от 01.08.2016 N 02-06-05/44946

Для зарплаты и начисленных на нее взносов порядок принятия бюджетных обязательств одинаков
Минфин рассмотрел ситуацию, когда по завершении финансового года получатель бюджетных средств принимает обязательства перед работниками по зарплате, компенсации за неиспользованный отпуск при увольнении и др. в пределах объемов лимитов бюджетных обязательств очередного финансового года.
Письмо Минфина России от 20.07.2016 N 02-06-10/42571